近年来，瓜果、蔬菜、花卉等具有重要经济价值的作物种植面积迅速扩大，保护地生产面积不断增加，设施农业高密度栽培及在同一块土地上连年种植一种作物，均有利于土传病害病原菌的积累、生长和繁殖。这类病害如果不及时加以控制，会造成严重减产或降低产品质量，甚至造成绝收。土壤消毒是控制土传病害的重要措施之一，已成为广大农民的迫切要求。常用的措施主要有合理轮作、增施有机肥、改造土壤和药剂消毒等。
　　
　　一、合理轮作
　　
　　轮作可合理利用土壤养分和水分，改善土壤结构，培肥地力。同时轮作时由于寄主植物不同，病虫赖以生存的环境条件发生巨变，大大减轻了病虫害的发生。也可消除由连作带来的作物分泌的有毒物质的积累而引起的作物中毒现象。
　　
　　二、增施有机肥
　　
　　有机肥有增加土壤有机质、改善土壤结构和耕性、增强土壤的保水、保肥能力、提高土壤温度、促进微生物活动等特殊的作用。增施有机肥还可稀释土壤中的病虫，减少病虫害的发生。
　　
　　三、改造土壤
　　
　　将肥沃熟化的无毒土壤掺入大田或苗床中，降低了病虫浓度，改变了病虫环境从而减少病虫的危害。
　　
　　四、土壤高温消毒处理
　　
　　1、太阳能消毒
　　
　　在温室作物采收后，连根拔除田间老株，多施有机肥料，然后把地翻平整好，在7—8月份，气温达35℃以上时，用透明吸热薄膜覆盖好，土壤温度可升至50—60℃，密闭15—20天，可杀死土壤中的各种病菌。
　　
　　小面积地块，可将配制好的培养土放在清洁的混凝土地面上、木板上或铁皮上，薄薄平摊，曝晒3—15天，即可杀死大量病菌孢子、菌丝和害虫卵、害虫、线虫。
　　
　　2、蒸汽热消毒
　　
　　用蒸汽锅炉加热，通过导管把蒸汽热能关到土壤中，使土壤温度升高，杀死病原菌，以达到防治土传病害的目的。这种消毒方法要求设备比较复杂，只适合经济价值较高的作物在苗床上小面积施用。
　　
　　（1）锅蒸消毒法;把营养土放入蒸笼内，加热到60—100℃持续30—60分钟（加热时间不宜太长，以免杀死能分解肥料的有益微生物，影响花卉的正常生长发育）。
　　
　　（2）消毒柜消毒法;先将一个大汽油桶或箱子等带盖容器改装成蒸气消毒柜，再从其壁上通入管子，与蒸气炉（暖气锅炉等）接通。将培养土装入柜（桶）内，打开进气管阀门，让蒸气进入土层的间隙，注意不要封盖太严，以防爆炸。30分钟后可杀灭大部分细菌、真菌、线虫和昆虫，并使大部分杂草种子丧失活力。
　　
　　3、水煮消毒
　　
　　把培养土倒入锅内，加水煮开30—60分钟，然后滤去水分晾干到适中湿度即可。此法只适合经济价值较高的作物在苗床上小面积施用。
　　
　　4、火烧消毒
　　
　　（1）炒灼法;保护地苗床或盆插、盆插用的少量土壤，可放入铁锅或铁板上加火烧灼，待土粒变干后再烧0.5—2小时，可将土中的病虫彻底消灭干净。此法的好处还在于可将土壤中的有机物烧成灰分，使扦插或播种基质更加纯洁，从而防止幼苗或插条发霉腐烂。
　　
　　（2）燃烧法;在露地苗床上，将干柴草平铺在田面上点燃，这样不但可以消灭表土中的病菌、害虫和虫卵，翻耕后还能增加一部分钾肥。
　　
　　五、药剂处理
　　
　　1、喷淋或浇灌法
　　
　　将药剂用清水稀释成一定浓度，用喷雾器喷淋于土壤表层，或直接灌到土壤中，使药液渗入土壤深层，杀死土中病菌。喷淋施药处理土壤适宜于大田、育苗营养土、草坪更新等。浇灌法施药适用于果树、瓜类、茄果类作物的灌溉和各种作物苗床消毒，防治苗期病害，效果显著。
　　
　　甲醛（福尔马林）消毒法
　　
　　（1）每1平方米土地用50ml甲醛，兑水6—12L或每0.1平方米土地用40%甲醛40ml，兑水1—3L。播前10—12天用细眼洒壶或喷雾器喷洒在播种地上，用薄膜严密覆盖，勿使通风，播前一周再揭开，使药液挥发。
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　　（2）每1平方米培养土中均匀洒上以40%甲醛400—500ml兑水50倍配成的稀释液，然后堆土，上盖塑料膜，密闭24—48小时，去掉覆盖物，摊开土，待甲醛气体完全挥发后便可。
　　
　　（3）用0.5%甲醛喷洒床土，拌匀后堆置，用薄膜密封5—7天，再揭去薄膜，令药味挥发。
　　
　　（4）砂石类基质可直接用50—100倍甲醛液浸泡2—4小时，排除药液后再用清水冲洗2—3遍。
　　
　　代森铵消毒法
　　
　　代森铵为有机硫杀菌剂，杀菌力强，能渗入植物体内，经植物分解后仍有一定肥效。用50%代森铵350倍液，每1平方米苗圃浇灌3kg稀释液。此法可防治花卉的黑斑病、霜霉病、白粉病、立枯病，还能有效地防治球根类种球的多种病害。
　　
　　波尔多液消毒法
　　
　　每1平方米苗圃用波尔多液（硫酸铜;石灰;水的比例为1;1;100）2.5kg，加赛力散10g喷洒土壤，待土壤稍干即可。此法对防治黑斑病、灰霉病、锈病、褐斑病、炭疽病等效果较明显。
　　
　　2、毒土法
　　
　　是将药剂配成毒土，然后施用。毒土的配制方法是将农药（乳油、可湿性粉剂）与具有一定湿度的细土按比例混匀制成。毒土的施用方法有沟施、穴施和撒施。
　　
　　3、熏蒸法
　　
　　利用土壤注射器或土壤消毒机将熏蒸剂注入土壤中，于土壤表面盖上薄膜等覆盖物，在密闭或半密闭的设施中使熏蒸剂的有毒气体在土壤中扩散，杀死病菌。土壤熏蒸后，待药剂充分散发后才能播种，否则，容易产生药害。常用的土壤熏蒸消毒剂有溴甲烷、甲醛等。此方法在设施农业中的草莓、西瓜、蔬菜的种植和苗木的苗床、绿地草坪栽植等方面均有应用。如每1平方米土地用45%百菌清烟剂1g熏棚5小时。
　　
　　注意事项。土壤消毒时，必须注意安全，使用前，先掌握使用方法，操作人员必须经过技术培训。不能在密闭的大棚内消毒，通风期间严禁从事农业耕作，正在消毒地块要有明显标识。（中国农机总网）